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2006年6月，中国国家科技部与天津市政府签署协议，共建“国家生物医药国际创新园”。作为“国家生物医药国际创新园”的核心和标志，率先启动建设澳门新葡亰登录入口，并形成国家科技部、商务部、原卫生部、原国家食品药品监督管理局与天津市人民政府“四部一市”共建机制。联合研究院以创新药物和生物医药共性、关键技术的研发为切入点，聚集一批国内外高水平人才、技术、项目，形成一批优质创新研究成果，努力建设成为优秀人才集聚和培养中心、国际合作的桥梁以及生物医药技术研发转化的领航区和标志区。
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2009年6月，联合研究院正式建成。并投入式使用。联合研究院探索并践行“政府搭台、市场机制；国有资产、企业运营；不设围墙、开放联合；国际认证、互利共赢”的建设和运营模式，构建“专业化大平台+众创空间+孵化器”新机制。国家科技部与天津市政府就为研究院确定了发展生物医药产业、培育新的经济增长点的宗旨，围绕这一宗旨，研究院在研发服务、企业孵化、产业咨询、人才引育等四个主要方面，持续用力，不断创新，为天津市、滨海新区生物医药产业发展提供了有力支撑和引领。
研究院建设了涵盖药物早期发现、临床前研究、临床试验、中试生产等药物开发的技术支撑平台，分析测试中心获中国合格评定国家认可委员会CNAS认证，药物安全评价中心获国家GLP资质，获得国家“十一五”、“十二五”、“十三五”重大新药创制专项支持，建设成为了全国新药研发综合性大平台之一，并在抗恶性肿瘤、重大传染性疾病防治、代谢性疾病治疗等方向开展了新药开发工作，突破了一批新药研发的关键技术和工艺。利用综合平台、专业化的人才队伍为国内外1000多家机构提供22万次以上的专业技术服务。
研究院首创“专业综合性大平台+众创空间+孵化器”新模式生物医药产业创新创业平台，建设了国家级孵化器、国家级众创空间，并入选科技部首批17家国家专业化众创空间、国家小微企业创业创新示范基地。联合研究院科技企业孵化器多年获评国家A类，截止到2021年，引进培育了400余个项目，既孵化了康希诺生物、丹娜生物、阿尔塔、昌和生物一大批留学归国人员创立企业，又吸引四川科伦药业、迪沙药业、辰欣药业、民生药业、河北仁和利康药业、国药集团中国医药卫生公司等重点医药企业在院建立研发中心，孵化培育科技型中小企业超过340家，聚集创客团队百余个。被授予国家海外高层次人才创新创业基地、国际科技合作基地、国家技术转移示范机构等荣誉称号。
作为生物医药领域的“高端人才聚集地、创新创业首选区”，联合研究院汇聚了18位国家级高端人才，47位天津市级高端人才，13位京津冀生物医药产业化示范区创业领军人才。并与南开大学、天津大学、天津中医药大学、天津科技大学等院校合作，联合培养研究生，迄今已毕业1040余名。并聘请诺贝尔奖获得者罗伯特·休伯、利兰·哈特韦尔为名誉院长，聘请陈竺、高福等12名院士作为专家指导委员会委员，聘请清华大学、南开大学、天津大学等高校多名教授在研究院兼职。
2013年5月14日，中共中央总书记习近平同志视察研究院，观看了该院自主研发产品展示，察看了分析测试中心、药物筛选中心等，详细了解国家创新药重大专项课题研发情况。习近平总书记对研究院的建设与发展给予充分肯定，并要求研究院不断提高科技创新能力，促进科技与经济的深度融合。